Aunque en general el clima en Ordesa es tipicamente pirenaico, la diferencia de altitud (desde los 750 m. de la entrada en el Cañón de Añisclo, hasta los 3355 m. del Monte Perdido) y la orientación de las laderas de los valles generan una enorme variedad climática.
Descacar las grandes variaciones de humedad y temperatura entre el día y la noche. Inversionjes térmicas que se reflejan en la distribución de los pisos de la vegetación, así como un sigular régimen de vientos de valle y montaña.
En el Parque Nacional podemos encontrar multitud de especies:
Arboles
Abedul (Bétula péndula)
Abeto (Abies alba)
Acebo (Llex aquifolium)
Alamo (Populus nigra)
Arce (Acer platanoides)
Avellano (Corylus avellana)
Fresno (Fraxinus excelsior)
Pino negro (Pinus unciata)
Roble (Quercus subpyrenaica)
Tejo (Taxus baccata)
Arbustos
Arándano (Vaccinium myrtillur)
Brezo (Calluna vulgaris)
Frambuesero (Rhododendrum ferrugineum)
Flores y plantas
Agrimonia (Agrimonia eupatoria)
Botón de oro (Trollius europaeus)
Diente de león (Taraxacum officinale)
Edelweiss (Leontopodium alpinum)
Fresa (Fragaria vesca)
Lirio (Lirium martagon)
Violeta (Viola odorata)
Oreja de Oso (ramondia pyrenaica)
Grasilla (Pinguiarla vulgaris)